Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vax1Q2NKI2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms