Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna5Q2MKA5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna5Q2MKA5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms