Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shroom4Q1W617 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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Shroom4Q1W617 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms