Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne9Q1RLL3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cpne9Q1RLL3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cpne9Q1RLL3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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