Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd300lgQ1ERP8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms