Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ptcd3Q14C51 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Ptcd3Q14C51 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ptcd3Q14C51 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ptcd3Q14C51 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ptcd3Q14C51 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptcd3Q14C51 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptcd3Q14C51 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms