Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ptchd1Q14B62 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ptchd1Q14B62 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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