Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rpusd3Q14AI6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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