Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cpne7Q0VE82 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms