Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc1Q0VDN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms