Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itgb8Q0VBD0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms