Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spata18Q0P557 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spata18Q0P557 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spata18Q0P557 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spata18Q0P557 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spata18Q0P557 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Spata18Q0P557 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms