Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Neurl1bQ0MW30 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Neurl1bQ0MW30 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms