Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2bQ0KL01 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms