Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnnm1Q0GA42 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms