Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms