Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms