Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou6f1Q07916 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms