Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tie1Q06806 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms