Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPINDOCQ05AH6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms