Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprgQ05909 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprgQ05909 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms