Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms