Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl7Q03366 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl7Q03366 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms