Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epha4Q03137 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Epha4Q03137 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms