Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkczQ02956 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms