Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms