Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp1Q01514 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms