Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja5Q01231 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja5Q01231 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms