Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col1a2Q01149 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms