Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelpQ01102 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelpQ01102 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SelpQ01102 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms