Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin2cQ01098 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin2cQ01098 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms