Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VegfaQ00731 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms