Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SeleQ00690 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SeleQ00690 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SeleQ00690 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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SeleQ00690 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms