Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms