Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb4P99026 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb4P99026 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms