Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cds1P98191 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cds1P98191 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms