Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cry1P97784 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cry1P97784 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms