Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
rp9P97762 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
rp9P97762 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
rp9P97762 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
rp9P97762 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
rp9P97762 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
rp9P97762 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
rp9P97762 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
rp9P97762 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
rp9P97762 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
rp9P97762 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
rp9P97762 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms