Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2cP97760 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms