Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AurkaP97477 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkaP97477 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AurkaP97477 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms