Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ext1P97464 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms