Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bop1P97452 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms