Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Meis3P97368 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Meis3P97368 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Meis3P97368 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Meis3P97368 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms