Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp1P97350 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms