Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RptnP97347 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RptnP97347 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RptnP97347 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RptnP97347 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RptnP97347 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RptnP97347 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms