Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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