Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TgfbiP82198 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms