Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctps1P70698 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctps1P70698 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms