Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tp53bp1P70399 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms