Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx3P70354 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 325.3 ms